①优良品种筛选与繁育:主要进行优良海水增养殖品种的筛选、引种、繁育研究，优良海水增养殖品种的生物学特性、繁殖生物学基础以及苗种繁育关键技术研究；优良种苗选育和苗种健康培育技术，无特定病原苗种生产技术等。
②健康养殖技术研究：高效、低耗、健康养殖技术、无公害水产品养殖技术；可持续的海水养殖种类健康养殖技术规范和海域环境资源友好养殖示范模式、技术体系的建立。
③海水养殖疫病与防控技术研究：重点开展了海水养殖鱼、虾、蟹类重大病害病原生物学、病理学、传播途径、流行规律、快速诊断检测技术以及防治方法等方面的研究工作。
④ 海水鱼类营养与饲料的研究：重点开展海水养殖对象的营养与代谢调控研究；饲料生物技术及新型饲料添加剂开发；饲料资源开发与利用。